「地毛かどうかは関係ない、規則だから黒く染めろ」なら問題ないな。
義務教育じゃないし、最初からある規則を適用しただけの話。
生徒側が自分のために規則を変えろってのは通らない。

でも、「日本人なら黒髪のはずだ」とか生徒の元の状態を考慮せずに
わざと脱色・染色した不良生徒だと決めつけてかかった、とかの部分は
事実関係を調べて本当なら教師を、誣告なら生徒を、厳しく処分しないとね。