税金で地方産業を振興させたときの問題はなにか?

それは補助金をもらえなかった企業が不当に競争から排除されていること。
ふるさと納税で補助金をもらえる企業の選別の段階で、市場がきちんと機能していない。
けっきょくは有力者にコネのあるゾンビ企業が生き残ることになる。