結論としてはこんな感じ

・WindowsもLinuxもOSパッチ当てれば大丈夫

・仮想マシンを動かすためのVTを使う環境(つまり仮想マシンを動かす用途)ではOSパッチによる影響が性能低下として顕在化する環境も今のところは存在する
現在情報があるのはLinux環境だけなので、これはつまりLinuxのKVMの現在の実装固有の話
(今後の環境に応じたチューニングとかはまだこれから)

・仮想マシンを動かす用途以外ではOSパッチによる性能低下はほとんどない