この女がクソ真面目すぎるんだよ。
「調査書を同封していなかったこと」を認めなきゃいい。

「私は確認して入れましたけど、そちらが紛失したんじゃないですか？」
「見つからないようであれば後日、郵送致します。」

これを女じゃなく、問題の着地点を大学側が提案するくらいじゃないといけない。