マイナンバーというユニークキーがあるから、重複申請チェックは大した手間ではないだろ。
郵送申請でも書き間違えて受け付けられる点は同じでは？
むしろ申請者自身がデータを打ち込んでくれる分、紙媒体の郵送申請よりも楽なのでは？