一般教養の域を脱すれば、正直物理選択でも生物選択でも勉強についていくことに関して大差ないのが実状です。まずは生理学、生化学といった基礎医学から勉強していくことになりますが、生物選択の学生でも「高校で勉強していないことばかりで結局一から勉強だよ」と言ってたりします。
医学部の勉強についていくという点では物理選択も生物選択も一長一短であり、長い目で見ればどちらでも良いのです。