まず部外者の学校侵入は難しいのでこれはない。
男子生徒が女子トイレに侵入するのは目立つからこの線もまずない。
となると怪しいのは生徒が全員帰った放課後に学校に残っても怪しまれない人物、すなわち教師だな。