揉めるポイントがよくわからん。
欠席扱いになるだけだろ。
留学でも体調不良でも欠席は欠席だろ。
甲子園の応援はその学校の特徴だろうし、それで学校維持してると思ってるんだろうから、私立だったらその辺は自由に考えていいのでは。