誰がどこの自治体で申請済というのを国単位でチェックしないと大変なことになるよ
ただ、戸籍と住民票を国単位でなく自治体レベルで管理してる限り、このような問題は本質的に解決できない
国が国民の情報を管理するのが大嫌いな人達の反対で叶わないだろうけど