いい案を思いついた。佐賀県も長崎県も受け入れられる案だ。
それは佐賀の在来線にもう1本線を増設（3線軌条）することだ

つまり今の単線区間は複線に、複線区間は3線区間に増設する
増設が終われば在来線路を3線軌条に改造、ホームもフル規格用に改造して完全複線とする
こうすれば増線工事期間中に在来線も運行可能になる

この案の最大メリットはフル規格の車両が通れること、新大阪発長崎行きが可能になる
さらに佐賀県が喜ぶ在来線の強化もできること
弱点は在来車両とホームの間に隙間ができることぐらい

在来線に沿った工事なので安く抑えられると思うが、高くついても佐賀県は金を出すだろう。