食べない
それは味噌汁の出汁用だから

昆布や煮干しを食べないのと同じこと

「シジミの○○（佃煮とか）」など
食べるために調理されてるシジミは食べる
ハマグリの吸い物など味噌汁の具として用いられてる貝類は食べる
出汁用のシジミは食べない