その前にだな、

国際法上海賊旗を掲げたシーチキンの船はその旗を掲げている時点で犯罪者と見なされどこの国、人物/警察でも問答無用で現行犯逮捕できる

今まで何もしなかったのは日本が優しいから。
本来なら同船している海上保安官が武力行使して逮捕すべき事案だったが放置していただけ。
今回のシーチキンの撤退は
・オーストラリア/ニュージーランドにシーチキンの船が寄港できなくなり、補給できなくなったから
・日本発行の国際手配赤札でオーストラリア/ニュージーランドの警察がシーチキンを逮捕するから
対テロ法とかか関係ないわ。

端的に言えば活動するための補給にメドが付かないから。