聞いた話では、もしJR会社間を跨いだICカード利用を認めると
経路のパターンが多すぎてシステムの計算量が増大するから難しいってことらしいが

そこらへんは経路を限定するなり工夫できないものかね

たとえば入場時刻をチェックすれば、不正乗車もある程度防げるだろうし