新型ウイルス検査(PCR)には欠陥があるのか？ 7回目で初めて陽性の例も
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新型コロナウイルスの検査が、誤った陰性判定を出しているのではないかと、深刻な懸念が生じている。
数カ国の報道によると、最終的に感染していると診断されるまでに、最も多くて6回、陰性と判定されていた人がいたとされる。
そうした中、今回の流行の発生源となった中国湖南省の当局はこのほど、検査で最終的に確認された段階ではなく、症状が見られた段階で感染者として数え始めた。
その結果、1日で約1万5000人の新たな感染が報告された。これは、今回の流行の全感染者の4分の1に近い人数だ。
検査に問題はある？
検査は、新型ウイルスの遺伝暗号（遺伝コード）が見つかるかどうかで判定する。
まず患者から検体を採取する。それを検査機関に運び、新型ウイルスの遺伝コードを取り出す（もし存在すれば）。それを繰り返しコピーし、検査できるよう大量に増やす。
この「RT-PCR」法の検査は、HIV（ヒト免疫不全ウイルス）やインフルエンザなどウイルスの診断に医療機関で広く採用されていて、通常は信頼性が高い。
「この検査は一般的に非常にしっかりしたもので、偽陽性や偽陰性が出る確率は低い」と、英キングス・コレッジ・ロンドンの研究者、ナタリー・マクダーモット医師は言う。
間違った結果を出している？
学術誌Radiology（放射線学）掲載の研究によると、患者167人のうち5人が、肺の画像が病気を示していたにもかかわらず、陰性と判定された。5人は後日の検査で、陽性と判定されたという。
こうした話はいくつもある。
新型ウイルスについて最初期に懸念を指摘し、感染によって死亡した後、今では英雄として称えられている李文亮医師の話もその1例だ。
李医師は検査で何回か陰性と判定された後、最終的に陽性と診断されたと説明していた。
中国人ジャーナリストたちは、6回の陰性判定の末に7回目の検査で陽性の結果が出たという複数の人の事例を報じている。
同様の問題は、シンガポールやタイなど、新型ウイルスの影響が及んでいる他の国々でもみられる。
一方、アメリカでは検査の一部で「判定不可能な」結果が出ていると、疾病対策センター（CDC）のナンシー・メソニア博士は話す
https://news.livedoor.com/lite/article_detail/17829576/ >>98
喉にウイルスある人もいる。だから難しいよね。
PCR検査結果だけを信用しすぎは初動を誤るかもしれない。 テクの問題なのか試薬の問題なのかコロナの特性なのか教えてくれ 1) ウイルスの部分集合にしかマッチしない「遺伝コード」である
2) ウイルスのDNA自体が 一つの静的な「遺伝コード」で表せない： 複数のコードの組み合わせ/時間的変化など
3) そもそも「遺伝子コード」では判別できない
どれなの？ RNAだからな。次世代シーケンサーでRNA丸ごと読めんか？ プライマーは変異が入りにくい場所で作ってるから変異のせいではなさそうだ 検体としてとった物の中にウイルスがまんべんなくいるわけではないっていう感じなのかな？
だったら理由はわかりやすい >>107
まんべんなくいる必要はない。細胞はまとめて溶解させるから わかったお(´･ω･`)
今の検査はど真ん中の球をホームラン打つ設定なわけやろ
ほかのストライクは見逃すか空振る
あるいはそもそも検体がダメ(球が投げられてない) まあバイオベンチャーなんか世界中小○方みたいな奴がデフォのとこあるので
この商機に「新しい検査方法はありまぁす！」って発表する奴のPRは話半分くらいで聞いといた方がいい >>103
唾液と相性が悪く、痰にほとんど含まれない
一方、腸内で大量増殖して、トイレで感染を広げている
とか適当な仮説をでっち上げてみる そもそも採取した検体にウィルスが含まれてなければ
PCRで増殖なんて出来ないからな
ウィルスが増えてからじゃないと、ほぼわからない
PCRは基本知識 ぶっとい針を胸に突き刺して、胚細胞生検すれば精度は上がるぞ >>85
喉、鼻、肺の細胞採取して検査すれば精度上がるぞ 微量検体からRNA取ってきてRT-PCRして、、ってすごい信頼性ないような気がしてならない。。
せめてqRT-PCRで30サイクル以内にCtがこないとね てかそこまで変異しやすかったら
勝手に死滅する可能性が増えるので
常識的に考えればそんな宿主に滞在してる間に劇的にあり方を変えて
毒性を持ち陽性になるときだけ同じ形になる、みたいなことがあるわけがない 武漢みたいに忙しくなれば他人の検体と間違えたりもあるだろうな
そうでなくても医療スタッフ疲れてるだろうし >>123
日本でも初期症状で陰性、後に陽性ってケースがある。 感染初期はウイルスの排出量が少ないか、サンプリングの方法だろ。
痰から取れるってことは、上気道にはウイルスが少なくて不十分。
気管か肺胞の成分が含まれた検体がベストって事だろ。 >>121
これ変異で検査をすり抜けてる訳ではないぞwww >>125
現在の日本のPCR検査の精度は33%〜50%といわれてるね >>126
ところが初期症状だと咳が無いから、痰がとりくいんだよなー。とことん厄介なウィルスだ。 ニュース検索したら長嶋一茂がPCR検査という言葉を用いているニュースが出て来て
原発事故でアホタレントが「半減期ガー核種がｰ」とか言い出したときと
同じ現象が起きてるのだなと思った 検体がちゃんととれてるなら
正しいものを見ている限り false negative はそうそう大きくないと思うが
まさか検体中で何か変わってる？ >>126
そこまで行ったらかなり症状が進行してるという事だろう
初期の無症状では陰性になりやすいのは当然 そもそも検体の取り方のエビデンスが無いんだから、陽性にならないからってPCRを疑うのは順番が違うとしか言えないな
前処理の方法も含めてデータが無いのにやってる検査なんだからさ >>129
初期症状での検査ですらほとんど当てにならん、まして無症状では。少なくとも陰性と出ても安心できんということだなー。
結局隔離が要る。 今気づいたんだが、中国でこんなに広まったのは、所構わず痰吐くからじゃないか？ >>133
つまり、濃厚接触者は検査だけではダメで全員隔離が要るってこったわな。冗談じゃないな。 >>136
中国旅行で屋台でたべるとかならずあたるからやめとけってさ >>36
感染研のプロトコルでは5コピー／サンプルだから相当引き伸ばしてる。
風呂の中のパチンコ玉を目隠しして磁石で引き上げるような作業だから当然すり抜けることもある。
金かけていいならNGSで風呂の水を全部調べることも可能だが、濃度考えたら一検体10万でも厳しいし設備も限られる。
まぁ中国ではNGSで回してるみたいだけどね。 「単位量あたりウィルスが5匹未満だったら絶対検査でひっかからない」
とかいうことではなくて
「ウィルスが5匹未満だったら引っかからないことがあるかもしれない」
くらいの話だからな >>136
やっぱり武漢で二カ月隠蔽してたのが大きい。その間感染者が隔離されず、世界中を歩き回ってた。 >>136
韓国人もそうだが唾飛ばしながらわめくように大声で喋る人間が多いのもでかいと思う >>132
ノドの粘膜取ろうがその中にウイルス入っていない時期がある上にその時期が人によってバラバラ >>135
クルーズ船で陰性のお墨付き出せと騒いでいた
市中感染が疑われ始め陰性のお墨付きが欲しくて相談窓口に電話してるヤツも多い
しかし現在のPCR検査精度の限界により陽性者の中から何割かの感染者をあぶり出す事は出来ても、陰性のお墨付きは絶対出せない
それなのに症状も無いのに検査を受けたがるwww 日本は、検査の数が少ないとか非難されてるが、安易に増やすと精度落ちそう >>146
今の日本の精度ても33〜50%しか無いそうだ 厄介だな。
水際で食い止めるべきだったのアベが入れてしまったから・・・ 朝鮮人の作った検査キット使えばいい。
全員陰性になるからハッピーだろ？ >>149
>>143
時期によっては検体内にウイルス入ってないのに検出できるはずもない 陽性結果は信頼性が高いけど、陰性結果の信頼性は低い
結果を見る人がそれを理解していれば良いだけの話 手製のゲルでPCRやったら2回に1回は失敗する
リアルタイムPCRでも3回に1回はウェルにいれ損なって失敗する。
96穴に1個1個間違わず入れていくって、箸で米粒を延々と掴むような作業すぎて、頭おかしくなるわ よく7回も検査してくれたなぁ
日本だったら陰性が出たんだから違う病気！とか言って2回くらいしか検査してくれなさそう 何人かの専門家が３０％の信頼性って言ってたな
ウィルス感染者のうち、陽性になるのが３０％って意味らしい
要するに、PCR検査の精度がその程度ってことなんだよ 感染初期は上気道にウイルスは少ないからスワブをリアルタイムPCRしても検出限界以下。
しかし激しい咳や痰など下気動からはウイルスは排出される。下手に陰性だと動き回って感染源になる。
検査は熱出てからだな。それまでは自宅警備員になるしかないな。 >>136
あーそうかもな。大阪も多いからすぐ蔓延しそう 欠陥もなにもウイルスが満遍なく存在しているのを拭って採取して1か0の判定をしろってもんじゃねーし
それでも検査検査と言って隔離する場所が無いのに煽るマスコミ >>154
96で入れ損なうような人はバイオ実験するのに向いてない。
自分は384プレートでやってたよ PCR「何者だ！」
COVID-19「ただの風邪です」
PCR「よし、通れ！」 健康診断で喀痰をしたことあるけど
あれ痰が出なくて唾液だけってこともあるから
本当に痰が絡んでる人でないと精度が落ちると思う そういうことだな。
関わった職員も感染してるし、離島に隔離が正解だった。 検体が混じったりしてなければ
陽性は体のどこかにウイルスがいるわけでガチじゃないの
発症させるほどの量があるか無いかは別だけど >>168
ウイルスは体全体どこでも均一にいる訳ではなく特定の部位に集中している
今回は感染していて本来陽性者がノドの奥の粘膜を最終したとしても高確率でウイルスが入っていないケースか続発して検査精度を下げている 秋葉原の昭和口マクドナルド閉店かー。
2軒隣のバーガーキングからのコメントも一緒に→感動と思いきや、ド畜生すぎる隠しメッセージ。
http://coyzi.bratten.org/35gt2e3/vgielm0g405l5w.html 日本でもあったから
帰国者で症状出てるのに 咽頭検査は 陰性
タンで陽性 検査実際にしたことある人ならわかるだろうけど、感染している患者でもウイルスのいる検体を採取するのが意外と難しいんだよ。
偽陰性になる理由は様々だが特に今回のウイルスは上気道より下気道中心に感染するので、ツバではなく肺から吐き出される喀痰が望ましいが、上手く痰を出せずにツバだけ採取して陰性というケースが多くなることが考えられる。 陽性→感染確定
陰性→検査には引っかからなかったが感染してるかは不明 https://www.niid.go.jp/niid/images/lab-manual/2019-nCoV20200204.pdf
これのリアルタイム版って２ステップ増幅（９５℃→６０℃）してるけど、
６０℃でちゃんとアニールするのかな？
リストにあるプローブだと、アニーリング温度が５２〜５６℃ぐらいだから
６０℃だと偽陰性出まくりのような気が・・・ 一般人にとっちゃリトマス試験紙程度のイメージだけど
実際のところ、検体採取も逆転写もPCRも失敗する余地ありまくり プライマー君「山！」
その辺のDNA・RNA君「へ？」
プライマー君「帰っていいぞ！」
プライマー君「山！」
新型ウイルス君「川！」
プライマー君「探してたで！（ガッチリ握手）」
PCR検査君「あ、陽性や」 >>154
アンタは実験に向いてない。
普通はそんなことないよ。
RNA抽出以降は慣れたおばちゃんが一番うまい。
問題は、ウイルスを含むサンプルを取ってくるのが難しい。 反応の閾値を越えるかどうかが陰性陽性の分水嶺みたいよ
だから数回検査して閾値未満の人でも体調如何で増殖したりすると
陽性に育つようだな >>3
いや、そんなの専門家の間ではとっくに常識だぞ？
感度50%で感染してても半分は見逃し
病期が長いから検体の採取時期とか検体の質の影響もかなりあると思うが 何回も検査失敗してやり直すよりも、最初から３ステップで、
９５℃→５６℃→７２℃とかちゃんとやった方が良いような気が・・・ >>172
格段の良好な採取は患者さん頼みだから難しいよねぇ
結核検査では本当に大事だし
ただ、新型コロナは「唾液が検体として有用」って論文も出てたんだよなぁ >>55
たしか人の皮膚にもRNAseってあるんだっけ 温度管理に失敗してちゃんと増えないとか､
サンプル採取に失敗して関係ないものを
増やしちゃうとかかな。 >>186
あなたの知識量が足りてないから鑑別できないだけでは？ ＰＣＲでＤＮＡ（ＲＮＡから逆転写したcＤＮＡ）を増幅してる最中には、
ＤＮＡは二本鎖になって結合しているので、９５〜９８℃ぐらいに加熱してやって、
二本の相補的なＤＮＡをバラバラな一本鎖にする
一本鎖になったＤＮＡを冷却すると、プライマー（プローブ）が相補的な塩基配列部分に結合する
プライマーが結合する温度は、プライマーの塩基配列や濃度などで熱力学的に決まる
（アニーリング温度）
プライマーが結合したら、７２℃ぐらいに加熱してやると、高温で活性を持つＤＮＡポリメラーゼ（酵素）が
プライマーが結合した部分から先の塩基を次々と追加して、相補的な二本鎖ＤＮＡにしてくれる
アニーリング温度を最適値より意図的に高くすると、ウイルスの遺伝子にプライマーが結合できないので、
陽性患者の数を減らすことができる >>153
だからこそ陰性でも隔離が必要になる、実に厄介なウィルスだ。 >>175
アニーリング温度下げて偽陽性出すよりはマシという判断では。
検査だから陽性見逃すより偽陽性出す方が後々責任問題になりそう。 場合によっては「陽性」「陰性」それぞれ3面ずつのサイコロの方が当たる確率が高い・・・ってわけでもないのか。 >>164
一緒に食事すると相当の高確率で感染するようだ。ビュッフェのバイキングとか鍋とか最悪。 >>129
PCR検査の精度が低いと言うより
検体にそもそもウィルスが含まれてないケースが多すぎる >>136
大気汚染で肺機能低下とか、肺疾患持ちが多いからだろう 人の体内で無害なもの擬態して存在を隠す進化を手に入れた 検体取る時にウイルス付いてないと出ないのは当たり前 そもそもRNAウイルスだからキットを使っても含有量によっては増幅させられないサンプルもある程度出てくるでしょうね
DNAなら楽勝なんだけど、RNAは不安定なんで ■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています
