【コロナ】ウイルスの変異と広がりの分析 約１５日ごとに「変異」か
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全国の都市部を中心に新型コロナウイルス感染症の蔓延は著しく、現在の日本の感染者数、死亡者数は、３週間前のニューヨークと同じだ。同じ轍を踏まないことが何より大切。日本では「３密」を避ける、というような曖昧な言い方が出回っているが、簡単に言えば、「Stay home, stay safe」ということである。（注：日本では軽症の感染者を自宅で療養させることについて不安や抵抗感があるようだが、医療機関の崩壊を防ぐためには必須と思われるー後述）
「新型コロナウイルス」の正式名はSARS-CoV2という。「SARS」の部分はSevere Acute Respiratory Syndromeの頭文字で、「重篤な急性の呼吸器の症候群」を意味している。SARSという名称は2002年に中国に広がった感染症であり、日本で「新型コロナウイルス感染症」と呼ばれるCOVID-19（こちらは病気の名前）と同じくコロナウイルスが原因だ。つまり「新型」という呼び名は付いているが、SARSの原因ウイルスの親戚のRNAウイルス。当初、SARSよりも症状が軽いと捉えられていた向きもあるが、実際には重篤化すると肺炎となり死に至る。
前回の拙ブログで、感染者の数や重症化の国による違いについて、人間の側からみて、意外なBCG接種との関係についての「仮説」（注：私だけが言い出していることではないー後述）を提示したが、今回は「ウイルスの側」から考察してみよう。
２月の週刊ダイヤモンド誌の連載コラム「大人のための最先端理科」の第253回の「もはや封じ込めは難しい 新型コロナの有効な備え方」に書いておいたが、このコロナウイルスは変異しやすい性質がある。
現代はオープンサイエンスの時代である。新しい発見はインターネット上のサーバに登録され、開かれた情報として提供される。新型コロナウイルスの場合は、新たな患者から単離されたウイルス試料をもとに、その遺伝情報（ウイルスの中ではリボ核酸ーRNAーという物質を媒体として記録されている）が日々、加わっている。National Geographicという科学雑誌では新型コロナウイルスの特集記事を組んでおり、「How coronavirus mutations can track its spread?and disprove conspiracies」という記事によれば、現在、Nextstrain.orgというサイトに1,500ほどの遺伝子情報が登録されているという。（注：このサイトが立ち上がったときに、ウイルス名は2019-nCoVだったので、その名前が使われている）
それらの解析によれば、驚くべきことに（予測していたとはいえ）、約15日ごとにこのウイルスは「変異」しているというのだ。
生命科学に馴染みの無い方には、ややわかりにくいかもしれないが、遺伝情報はウイルスが増殖するときに「コピー」される。この際、コピーミスが生じると、それが「変異」となる。
「変異」によってはウイルスの性質が変化する可能性がある。例えば、コウモリにしか感染しなかったタイプが、ヒトに感染できるようになるとか、より粘膜の細胞に侵入しやすくなるとか、より感染力が強くなる、など。
そして、時系列に沿ってどのような変異が生じたのかを追跡することにより、ウイルスの伝播をたどることができる。ちょうど、手書きで書き写された古典資料の経緯を追う書誌学で行われる分析方法と、原理的にやり方は同じだ。
https://static.blogos.com/media/img/326041/raw.png
このサイトは有り難いことに、リアルタイムの状況を例えば日本語で読める（図は３月２７日付け）。この世界地図上の色分けは、下記の図の時系列情報を組み込んだ「系統樹」とカラーコードが対応している。
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この図では、日本に伝播したウイルスは紫か青のものがほとんどで、それは、武漢で蔓延した古典的なタイプに近いもののように思われる。一方、欧州でパンデミックになっているのは黄色かオレンジのタイプとライトブルーのものがある。
このデータベースはインタラクティブに作られているので、例えば「アジアのデータ」のみを抽出することも可能。ただし、この図でわかることは、日本からのサンプルの提供が少ないことだ。２月や３月になってからのスポットが系統樹にあまりプロットされていない。
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拙ブログ主は、このことは日本の医学生物学、生命科学研究の状態が宜しくないことを意味すると思っている。
続きはソースで
https://blogos.com/article/448096/ たった15日で環境に適応して進化するんか
こりゃ暖かくなっても俄然コロナ菌活発で元気なわけだ
梅雨も夏もコロちゃん収まらんかもな 〜ウィルスは変異している
暑い国でも蔓延していたり再感染している中国人が重症化したり突然死してるのが物語っている
気温30度以上あるタイやインドで蔓延しているのだ
夏になったら終わらないのだ
もう五輪も治療もクソもない、いきなり肺が潰れて死ぬ事もある
高齢者だけ重症化って訳ではないのだ
そして、一度治っても再発する
政府は隠蔽しているが日本も現時点での潜伏感染者は10万人超えだ
福島の時のようにパニックになるのを避けているだけ
もう打つ手はない、経済活動は停止し、、、
あの世界人口の3分の1が死ぬ予言は的中する >>6
ほんこれ
疑問形にすれば責任逃れ出来ると思って、調べられることもろくに調べもせず裏づけも取らずに思いつきだけで書く無能ライターが多すぎ しかしウイルスってただのタンパク質だろ
そんな大したことなさそうだけどな >>5
ウイルス進化論って、ウイルス自体の進化を論じている訳ではなく、ウイルスが生物の進化の要因の一つって仮説じゃない？
ついでに言うとトンデモ系のはず >>1
細菌戦争なだけだよ、変異スピードの早さも予想通りか
人類やばいぞ とどのつまりこのウイルスのワクチン開発は出来ない、ということ？ >>4
☓環境に適応して進化する
○変化したもののうち環境に適応したものが増加する >>19
上は種として見た場合の言い方で
下は個々として見た場合の言い方やね お前らは少しは海外の学術レポートを読むことを覚えた方が良いぞ。
ウイルスが変異するのは常識だ。
大小の変化の中で多くく変異したものが『変異株』と呼ばれる。
これは、『抗体が効かないのではないか？』と疑われるほどの変化をしたものを意味し、
病原体としては別種と考えられる。
で、この変異株は初期の段階で53種類あったのではないかと見られている。
そこからさらに変異しながら世界に拡散し行き来している状況だ。
これがいかに恐ろしいことか、察しの良い者ならすぐに気づく。
薬の開発は困難であるし、それどころか『再感染するリスク』がある。
だからこそ中国は必死で嘘を世界中にばら撒いているんだ。
このような危機で、『自粛の呼びかけ』だけでなんとかなると思っているやつが居たら、
そいつらはアホだ。 >>23 枝分かれするからな。
無毒化するのもあれば猛毒化するのもある。 緊急寄稿（1）新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のウイルス学的特徴と感染様式の考察（白木公康）
ttps://www.jmedj.co.jp/journal/paper/detail.php?id=14278
＞コロナウイルスはRNAウイルスでは例外的に変異を起こしにくい。コロナウイルスは校正機能を有する酵素を持つので，変異が起きても，それを除去して正しく遺伝子を複製する。 変異はあるとみてまちがいないでしょ
人類の危機ですわ 変異したら弱毒なものが残るよね。
強毒は人間を殺した時点で焼却処分を繰り返していくうちに数を減らし自然淘汰。
弱毒は通常の風邪扱いで問題にされずに残る。
終息があるなら弱毒蔓延かな？ コロナウイルスですら２週間で本気出すのに
おまえらときたら RNAレトロウイルスはDNA染色体と比べて
200万倍変異しやすいと言われてるからな
1年経ったらまた罹る >>33
インフルはそうだけどコロナは変わりにくいってアビガン開発のオッチャンが言ってた 新型コロナが変異しながらも生き残ったとしても、人の免疫は今回出会った新型コロナの記憶を覚えていて
今回よりは重症化はしないのでは？
当然、今回の新型コロナを生き残った人の免疫は強い。弱毒化した場合の新型コロナなど敵ではない。
インフルエンザの歴史をみると新型コロナもずっと生き残りそうだけど。 専門性から言って、>>26の示した学術論文の方が的を射ているだろう。
大隅さんは専門外の神経科学者なんだから、少し考えてください。 変異ってなんだよそれェ・・・
ワクチン研究してるらしいけど意味あんのそれ？ >>38
？？？「ウイルスのアップデートには極力対応していきます」 >>38
外側さえ変わらなければ、
RNAがどんなに変異しても大丈夫ですよ 超進化系ウイルスなの？何か無敵だね薬つくってもすぐ耐性獲得すんじゃね
こりゃ３年くらい暴れまくるな 感染してない人は取り敢えず葛根湯飲んどけって話ですか >>31
今ぐらいの伝染力なら人がほとんどいなくなるまで数減らないでしょ ＲＮＡウィルスなんて、１０００個に一個はコピーエラーを出して、
たいていは役立たずになるんだけど、
たまにそのエラーで、生存により有利な性質を身に着けるヤツが出てくる。
そうすると、そのエラーの子孫が一機に蔓延る。
インフルエンザなんかもそうだけど、
ＲＮＡウィルスはその繰り返しで、しつこく残り続けることができる。 もう最近は日本が仕掛けたウィルスじゃないかって思ってきた
死者が少ないのも頑なにロックダウンしないのも
日本人には致死的にならないって分かってるからしないのでは？ >>日本の医学生物学、生命科学研究の状態が宜しくないことを意味する
あれだけ疫学で論文改竄やってるんだから
日本にまともな専門家はいない 「新型コロナウイルス」の正式名はキンペー-殺人ウイルス兵器という。 >>45
中国初のウイルスであることは明白です。
中国人が仕掛けたテロなんですよこれは
お前のお仲間のね DNAに比べてRNAは構造的に不安定なので、RNAウイルスで変異が起こるのは日常茶飯事。
ただし、それらの変異が即致命的になるなんて事は、そうしょっちゅう起こるわけでもない。 >>56
で言われてるのは人為的に改変したんじゃないの？ってことだよね？ ウイルスは、自らのコピーを最大限に増やそうという戦略の元に行動しているように見える。
ウイルスが増殖するためには、特定の生物の細胞に侵入し、その細胞の機能を
乗っ取って増殖し、増えたウイルスは細胞から飛び出して、他の生物に
感染することを繰り返す。
感染力×増殖力が大きいほど効率よく増殖できる。
しかし、増殖力が大きすぎて宿主の細胞の機能をすべて乗っ取ってしまうと
宿主は死んでしまい、ウイルスもそれ以上増殖できなくなってしまう。
だから、ウイルスからすれば、宿主を殺さない範囲で増殖した方が有利だ。
ウイルス遺伝子が突然変異を繰り返すうちに、より感染力が強く、
病原性はほどほどのものが選択されて増えていくことになるだろう。 日本人だけ大丈夫ってのはないと思うんだよな
やっぱり変異して強くなって欧州ではあんななったのかも 私たちはスマホを使いこなす、進化した人間だから大丈夫だ。 >>64
一応、その可能性は頭の中に置いといた方がいいわな。
で、感染するのに時間差があるのはなんでなん?という疑問もあるのよなぁ。
今どき、たいていのウイルスさんはヒコーキ（に乗った感染者）で日本にやってくるんだろうけど、
それならそんなに日にちの差は出ないだろうにと思うんだがなぁ。空港に着いてからの伝播スピードは
そら落ちるだろうけど。 週刊ダイアモンドと朝日新聞と毎日新聞とリクルートは
２０年前、氷河期の理系を「ゆとり」とか言って叩きまくっていたからなあ
本当の「ゆとり」は２００１年以降に高校を卒業した連中なんだぜ・・・ 日本株のBCGが欧米で広がってるタイプのコロナに有効なら良いが、
そうじゃないなら、いずれ日本も欧米並みの致死率になる可能性があるわけか。 >>66
ここ1〜2週間で感染者急増してるのが欧州産のS型でしょ >>69
そういう問題じゃない
アジアと欧米の差はBCGとは関係なくウイルスの違いかもって話 >>73
日本人の感染者数と死亡率が低いことから
日本の陰謀説が高まってきているよ >>１
ここには新型コロナウイルスは変異しにくい方のウイルスみたいに書いてるけどなぁ。
日本医事新報へ白木公康教授が寄稿した文章の中で変異しにくい理屈も含め書いてる。
https://www.jmedj.co.jp/journal/paper/detail.php?id=14278 >>72
文意が理解出来ないのか？
BCG有効は仮説に過ぎないが、日本で流行しているコロナタイプを抑えてる可能性があるならって事だよ。
欧米が日本とは違うタイプのコロナなら、日本株BCGの有効性も変わるかもしれないし。
ただ、日本株BCGのポルトガルは致死率が低くて、海外のサイトでも話題になってたが。
まあ、BCG関連の話は眉唾だけどな。 >>1
そんな変性しまくるコロナに日本が耐えられているのはなぜか？
そう、全てはBCG神の御加護ぞ、感謝せい そのうち弱毒化する
サイトカインストーム起こすのはウイルス側としても嫌だろうし まあウイルス自体も自らが生き延びるためには自然と共存関係に持っていくのだろう >>72
欧州ウイルスなんて1か月以上前からバンバン入ってきてるじゃんね。
イタリアもスペインもフランスもエジプトもアメリカその他各種揃ってます状態。
一番頑張ってるのが、京都産業大学のヤツラのか？ >>80
だよな。とっくの昔に欧州由来?のも入って来てるはずだよなぁ。
で、俺としちゃあ感染力よりも致死率というか、重症になりやすい度が気になるのよな。
だって、日本と他の国とでは感染者数の比較ができないから。 一度コロナに感染して抗体出来た人が変異したウイルスに感染したらどうなるの？
変異しても免疫できるから大丈夫？ >>82
変異も程度によるからね
普通に変異するぐらいなら、一度免疫ができたら次にかかるときは軽症
インフルエンザも同じ エイズウイルスなんかは潜伏期間中でも変異して感染者の体内に
2種類以上のエイズウイルスが存在してることも珍しくないらしいな これって病院で入院してると
毎日のように新型の新型武漢ウイルス患者が入荷してるってことじゃん
医師が院内感染してるんだから患者同士も当然新型に院内感染して
身体が治る暇がなく重篤化して死ぬんだろうな そのうち飛沫感染じゃなく気中滞在で増殖して換気すればする程酷くなったりして >>88
頭がツルツルになる変異になったらどうすんだよ >>82
研究が進んでいないから、世界中の誰にもわからない。
一度PCR検査で白になった患者が数日後〜数週後に再発するのも、
1)一時的にウイルスが生りを潜める派
2)抗体が効かない亜種に感染した派
3)同種だけど免疫が上手く効いてないんじゃない派
3-1)免疫系の効力がすく切れるよ派
3-2)免疫系が暴走するよ派(サイトカインストーム派)
3-3)そもそも免疫獲得できないよ派(エイズ派)
と色々な話が出てる状態だし こんなご時世じゃ治療と封じ込め最優先で色んな疑惑の研究も進まんか。1日も早く収まって解明にして欲しい 15日でその土地に適応した種が残って広がるパターンだな
これで世界中で拡大している理由がわかった
このウイルスには苦手な場所がないってことだ >>87
それはもはやウイルスではない、ただの毒だ >>4
馬鹿だな
人間も合わせて変異すればいいだけの話 >>87
ウイルスは自己増殖はできない
宿主の細胞を使って増殖する 15日ごとに変異するウイルスとか
ワクチンとか作れるのかこれ >>98
変異しても免疫学的に別物にならない限りはワクチン効くからね
インフルエンザよりは変異少ないって話だし
インフルエンザもワクチン効かない変異はまずないよね >>98
基本的にウイルスなんて小さな変異は頻繁にしてんだよ
この15日で変異してるってのもその程度の変異
別種と言えるほど変異しないならワクチンは有効
そのレベルでの変異はそうそうおこらない ■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています
