こんな機械式のドライブで音が変わるのならピップアップの駆動電流のバタつきやスピンドルモーターがアナログ回路へ影響与えてるんだよ。
CDのデータを全てメモリーに格納して回転やピップアップ停止して再生したら良いのだよ。